Важной особенностью географической структуры внешнеторговых связей является их концентрация на США и КНР, На американском рынке реализуется 25% японского экспорта и обеспечивается 15,4% импорта. В свою очередь Япония — один из крупнейших торговых партнеров США после Канады, КНР, Мексики — до 10% американского экспорта. В импорте из США возросла доля минерального сырья и сельскохозяйственной продукции.
Япония выступает основным торговым партнером ряда стран Восточной и Юго-Восточной Азии. Она обеспечивает Индонезии 37% ее экспорта и 24% импорта, Малайзии — 26% ее импорта и 16% экспорта, Сингапуру — 21% его импорта и 17% экспорта, Южной Корее — 26% ее импорта. Япония является также основным экспортным и импортным рынком КНР.
В мировом движении технологии Япония занимает своеобразное место. Она импортирует всю технологию из индустриальных стран, а экспортирует почти поровну в развитые и развивающиеся страны. 40% общего объема экспорта технологии вывозится в страны Азии. Японские компании расширяют научно-техническое сотрудничество и развитие промышленной кооперации с Восточной и Юго-Восточной Азией, стремясь перевести производство продукции средней сложности в соседние страны, а самим сосредоточиться на разработке и освоении технологически сложной продукции.